تتولى إدارة الرواتب والأجور إدارة كل ما يتعلق بالرواتب من علاوات وبدلات مالية وكذا إعداد التصفيات والمطالبات وميزانية العمل الإضافي والانتدابات والتعويضات لجميع موظفي الجامعة.